5 квітня 2001 року Микола Іванович Козюбра брав безпосередню участь у винесенні рішення у справі за конституційним поданням Президента України щодо конституційності Закону України «Про внесення змін до деяких законодавчих актів України» або справі про податки. Подання Президента України Леоніда Кучми стосувалося неконституційності змін до Декрету Кабінету Міністрів України «Про прибутковий податок громадян», «Про державне мито» та Закону України «Про збір на обов’язкове державне пенсійне страхування». Президент України порушив питання про неконституційність Закону, оскільки прикінцеві положення Декрету стверджували, що його окремі положення поширюються на правовідносини, які виникли до набрання чинності цим Декретом». Леонід Кучна вважав, що Закон повинен бути визнаним неконституційним, оскільки він суперечить статті 58 Конституції України, яка стверджує: «Закони та інші нормативно-правові акти не мають зворотної дії в часі, крім випадків, коли вони пом'якшують або скасовують відповідальність особи». Крім того, Президент України зазначав, що статтею 2 розділу I Закону до Декрету внесено зміни, які порівняно з чинною редакцією Декрету применшують коло операцій, за які сплачується державне мито. К. Массійс, “Лихвар та його дружина” "ЗАЗНАЧЕНЕ ЗВУЖЕННЯ БАЗИ СПРАВЛЯННЯ ДЕРЖАВНОГО МИТА ПРИЗВЕДЕ МІСЦЕВІ БЮДЖЕТИ ДО ВТРАТ", – СТВЕРДЖУВАВ ПРЕЗИДЕНТ УКРАЇНИ. «Таке прийняття є порушенням принципу, зазначеного у статті 95 Конституції України, відповідно до якого держава прагне до збалансованості бюджету», - було вказано в поданні. Ба більше, було присутнє недодержання вимог статті 34 Закону України «Про бюджетну систему України» стосовно джерел покриття скорочення надходжень до місцевих бюджетів. 45